1958年,北京市农业学校创建。
1960年初,北京市农业学校由茶淀(现属天津市宁河县界内)迁入北京市。
1994年,成为北京市首批被国家教委确定为国家级重点中专。
1999年,北京市农业广播电视学校正式并入北京市农业学校。
1984年,北京市农业管理干部学院成立。
1997年,被市教委评为北京市高等学校示范校。
2001年6月,北京市农业学校和北京市农业管理干部学院合并组建北京农业职业学院。
2002年4月,北京农业职业学院正式挂牌。
2003年5月,合并原北京市城乡建设学校。
2004年12月,整建制合并原北京市城乡建设学校及原北京市八一农业机械化学校,成立北苑分院、清河分院,形成“一院四区”办学格局。
2005年10月,学院被中央精神文明建设指导委员会评为“全国文明单位”。
2006年3月,被市教委等部门联合授予“北京市职业教育先进单位”荣誉称号。
2008年7月,被确定为第三批国家示范性高等职业院校建设单位。
2015年12月,成为京津冀农林高校协同创新联盟成员。
2016年8月,入选第二批国家现代学徒制试点单位。
2019年7月,被教育部认定为国家优质专科高等职业院校。
2019年10月,通过教育部现代学徒制第二批试点单位验收。
2019年12月,被教育部、财政部列入第三类高水平专业群建设单位(A档),“园艺技术”入选全国高水平专业群。
2020年11月,担任中国休闲农业产教联盟第一届联盟理事单位。
2024年4月19日,北京农业职业学院召开京西南农耕文化研究中心成立。








